受到監管部門的處罰：未進行ODI備案可能被視為違反相關法規，監管部門有權對違規企業進行處罰，這可能包括罰款、責令改正等措施。對于嚴重違規的企業，還可能會面臨更加嚴厲的處罰，例如吊銷營業執照等。

資金流轉受阻：未進行ODI備案的企業在境外投資的資金可能無法正常流轉。具體來說，投資資金將無法通過銀行順利匯出，導致無法完成投資工作。同樣，境外公司的利潤分紅等也無法通過銀行渠道匯進國內，給企業的資金管理帶來極大的不便。

法律風險增加：境外投資行為可能被視為違規，企業可能因此面臨被要求撤回投資或承擔相應法律責任的風險。這不僅會影響企業的投資計劃，還可能對企業的聲譽和長期發展造成不良影響。

無法享受政府補貼和獎勵：未辦理ODI備案手續的企業將無法享受我國政府相關補貼和獎勵，例如境外知識產權糾紛和“兩反一保”應訴補貼等。這對于企業在境外投資過程中的資金支持和風險應對能力將產生不利影響。

影響企業上市和融資：對于計劃未來在境外上市或進行融資的企業來說，未進行ODI備案可能會成為其上市的障礙或影響其融資能力。因為資本市場和投資者通常會對企業的合規性和透明度有較高要求。